培根提出了到达各种现象的一般原因的真实方法—科学归纳法。在《新工具》中，培根把实验和归纳看作相辅相成的科学发现的工具。他看到了实验对于揭示自然奥秘的效用。培根认为科学研究应该使用以观察和实验为基础的归纳法。培根的归纳法对于科学发展，尤其是逻辑学的发展做出了贡献。
培根在《新工具》中，阐述了他的科学归纳法。他认为，归纳法是从事物中找出公理和概念的妥当方法，同时也是进行正确思维和探索真理的重要工具。要获得真正的知识，归纳方法是不可缺少的。他说：“我们的唯一希望乃在一个真正的归纳法。”“归纳法就是为获得真实证明的方法。归纳逻辑不是在知识问题上研究，而是对自然的权力之艺术的科学。”“他指出：“归纳法是发现个体事物发展变化的法则的工具，是获得支配绝对现实的规律和能起决定性作用的形式的方法。培根提出的归纳法，不同于简单枚举归纳，是种排除式的归纳法。他曾这样阐述：对于科学与技术的发现和证明有用的归纳法，则必须要用适当的拒绝和排斥的方法来分析自然，然后，在得到足够数目的反面例证之后，再根据正面例证来作出结论。培根科学归纳法的特点在于，通过查阅存在表、缺乏表和程度表，利用排除法可以逐步排除外在的、偶然的联系，提纯出事物之间内在的、本质的联系。总之，培根归纳法就是从观察和实验的事实材料出发，通过排斥法来发现周围现实的各种现象间的因果关系。
培根归纳法的目的是要给人们带来新的知识，它是一种认识的工具，而不是议论的工具。培根强调：“我的逻辑对理解力的教导，宗旨不在使它以心灵的纤弱卷须去攫握一些抽象概念（像普通的逻辑那样），而在使它可以真正地解剖自然，可以真正地发现物体的性德和活动，连同其在物质中被规定下的法则。“我的解释方法不限于涉及心的活动或思论（如普通逻辑那样），而且还涉及事物的性质，所以我要对人心提供一种规则和指导，使它在每一情节都能恰当地把自己投在事物的性质上。”
显然，培根关于归纳逻辑的职责的规定，是与传统的逻辑大相径庭的。培根不仅强调了归纳逻辑要研究思维纯形式的方面，更为主要的，他强调了要研究思维反映客观事物、把握事物本质和规律的方法问题。培根的科学归纳法正是以个别的事实陈述为据，通过探询和判明客观事物的因果性必然联系，作出关于事物现象运动变化的一般结论，从而提供关于事物形式（即规律）的认识。